軟件介紹

VMD是一款適用于Linux操作系統(tǒng)的分子運(yùn)動(dòng)繪圖分析模擬軟件，我們可以通過(guò)VMD免費(fèi)版來(lái)對(duì)分子運(yùn)動(dòng)繪圖進(jìn)行分析處理，并且可以快速模擬出運(yùn)動(dòng)場(chǎng)景，從而讓你可以快速了解分子運(yùn)動(dòng)的全過(guò)程。

軟件簡(jiǎn)介

VMD Linux版是款適用于Linux操作系統(tǒng)的分子運(yùn)動(dòng)繪圖分析模擬軟件。它可以真實(shí)的模擬分析的運(yùn)動(dòng)場(chǎng)景，提供可視化的圖形界面，幫助用戶更好的理解分析變化，提高研究效率，操作簡(jiǎn)單，方便快捷，非常好用。

VMD是專門為建模、可視化和分析生物大分子(如蛋白質(zhì)、核酸等)。可讀取PDB文件并顯示，并提供多種分析、可視化選擇、渲染方法，還可以對(duì)分子動(dòng)力學(xué)（MD）模擬的軌跡進(jìn)行處理和分析。

VMD使用說(shuō)明

VMD（Variational mode decomposition）是一種自適應(yīng)、完全非遞歸的模態(tài)變分和信號(hào)處理的方法。

該技術(shù)具有可以確定模態(tài)分解個(gè)數(shù)的優(yōu)點(diǎn)，其自適應(yīng)性表現(xiàn)在根據(jù)實(shí)際情況確定所給序列的模態(tài)分解個(gè)數(shù)，隨后的搜索和求解過(guò)程中可以自適應(yīng)地匹配每種模態(tài)的最佳中心頻率和有限帶寬，并且可以實(shí)現(xiàn)固有模態(tài)分量（IMF）的有效分離、信號(hào)的頻域劃分、進(jìn)而得到給定信號(hào)的有效分解成分，最終獲得變分問(wèn)題的最優(yōu)解。

它克服了EMD方法存在端點(diǎn)效應(yīng)和模態(tài)分量混疊的問(wèn)題，并且具有更堅(jiān)實(shí)的數(shù)學(xué)理論基礎(chǔ)，可以降低復(fù)雜度高和非線性強(qiáng)的時(shí)間序列非平穩(wěn)性，分解獲得包含多個(gè)不同頻率尺度且相對(duì)平穩(wěn)的子序列，適用于非平穩(wěn)性的序列，VMD的核心思想是構(gòu)建和求解變分問(wèn)題。